magnesian est un jeu de puzzles et de plateforme. le gameplay est centré sur autour de la manipulation de la polarité magnétique, en particulier celle des objets spécifiques de l'environnement. chaque section du monde du jeu charge les joueurs de résoudre des puzzles de difficulté et de structure variable. grâce à un faisceau laser, le joueur peut interagir avec les objets qui peuvent avoir à la fois une magnétisation positive ou négative. dans des niveaux plus avancés, il faut changer la magnétisation des objets pour résoudre les puzzles.